Алфеевцы откололись от Геннадиевской ветви Истинно-Православной Церкви. Основателем нового течения стал архиепископ Алфей Барнаульский, по имени которого это ответвление ИПЦ и получило свое название.
Взгляды алфеевцев и геннадиевцев практически ничем не отличаются, поэтому обе ветви состоят в евхаристическом общении, хотя и существуют автономно.