Христианство получило распространение в Евгипте уже в I веке. По преданию, первым египетским епископом стал св. Евангелист Марк. Александрия Египетская вскоре стала крупнейшим христианским центром в Африке. Возникший впоследствии Александрийский Патриархат распространил свое влияние не только на Египет, но и на всю Северную Африку.
В эпоху христологических споров V века в Египетской Церкви произошел раскол. Высшая иерархия и большая часть духовенства и верующих не признали постановлений Халкидонского Собора 451 г. Таким образом появилась автономная монофизитская церковь, получившая название Коптской Церкви.
Те египетские христиане, кто принял учение Халкидонского Собора, сформировали Александрийскую Православную Церковь, состоящую в церковном общении с другими поместными Православными Церквами.
После раскола 1054 г. Александрийский Патриарх, находившийся к тому времени в полной зависимости от Константинополя, разорвал отношения с Католической Церковью.